本发明提供一种尿嘧啶类化合物的纯化方法，属于医药中间体纯化领域，该方法将初步纯化得到的尿嘧啶类化合物粗品热溶于极性非质子溶剂，通过降温重结晶析出初步纯化的尿嘧啶类化合物固体，然后选择合适的溶剂对尿嘧啶类化合物进行打浆，溶解出包含在尿嘧啶类化合物固体中的色素等杂质，经过洗涤干燥，得到纯度较高的尿嘧啶类化合物。该方法采用优化了的重结晶工艺提纯尿嘧啶类化合物，解决了现有技术中尿嘧啶类化合物纯化效率低下的问题。尤其是解决了现有技术无法高效纯化公斤级或吨级尿嘧啶类化合物的技术问题，提高了生产效率，降低生产成本。