本发明属于生物与新医药中轻工和化工生物技术的天然产物有效成份的分离提取技术，涉及提取与应用领域，具体为一种螺旋藻藻蓝蛋白的提取方法及应用。该制备方法的步骤如下：1)将干燥的螺旋藻粉碎，过筛；2)向螺旋藻粉末中加入磷酸盐缓冲液，混合均匀；3)将料液置于4℃环境中溶胀，溶胀后将料液进行超细剪切；4)将提取液进行离心，得到上清液；5)向上清液中缓慢加入硫酸铵，静置，离心得到上清液；6)向上清液中继续缓慢加入硫酸铵，静置，离心得到蓝色沉淀；7)将沉淀物冷冻干燥得藻蓝蛋白。本发明采用溶胀‑超细剪切法相结合破壁技术，用时短、藻蓝蛋白得率高，制备的螺旋藻藻蓝蛋白提取物对HeLa细胞的增殖具有明显的抑制作用。