本发明涉及水栀子中3, 4‑裂环环菠萝蜜烷型栀子新萜A和栀子新萜F的制备方法及其应用，有效解决快速从水栀子中制备两个具有肾细胞保护活性的3, 4‑裂环环菠萝蜜烷型三萜类化合物的问题，方法是，将水栀子粉碎，丙酮组织破碎提取，减压浓缩，浓缩物用蒸馏水混悬，依次加入石油醚、乙酸乙酯，减压回收溶剂，得水栀子粗提取物；水栀子粗提取物经硅胶柱色谱初步分离，采用体积比为100 : 1、50 : 1、30 : 1的二氯甲烷‑甲醇系统进行梯度洗脱，收集二氯甲烷‑甲醇体积比为50 : 1、30 : 1洗脱流份；二氯甲烷‑甲醇体积比为50 : 1洗脱流份经硅胶柱色谱进一步分离，得栀子新萜A；二氯甲烷‑甲醇体积比为30 : 1洗脱流份经ODS柱色谱进一步分离，得栀子新萜F；本发明方法稳定可靠，效率高。