本发明涉及水栀子单萜类化合物crocusatinN和jasminosideB制备方法及应用，可有效解决快速从水栀子中制备具有肾细胞保护活性的环香叶烷型单萜类化合物，并制备保护肾细胞活性药物的问题，水栀子粉碎，丙酮提取，浓缩，浓缩物蒸馏水混悬，依次加入石油醚、乙酸乙酯，减压回收溶剂，得水栀子粗提取物；将水栀子粗提取物经硅胶柱色谱初步分离，收集二氯甲烷‑甲醇体积比为30 : 1和8 : 1洗脱流份；二氯甲烷‑甲醇体积比为30 : 1的洗脱流份经ODS柱色谱用体积比为20：80、30：70的甲醇‑水梯度洗脱，收集30 : 70洗脱流份，纯化，得crocusatin N；二氯甲烷‑甲醇体积比为8 : 1洗脱流份经硅胶柱色谱用体积比为10 : 1，5 : 1的二氯甲烷‑甲醇梯度洗脱，收集10 : 1洗脱流份，纯化，得jasminoside B。