本发明属于健康产品领域，涉及一种女性专用益生菌组合物及其应用。本发明所述的女性专用益生菌组合物，其特征为包括女性益生乳杆菌、稳定剂和吸附剂，所含的比例分别为女性益生乳杆菌3％～20％；稳定剂5％～50％；吸附剂30％～80％。本发明所述的女性专用益生菌组合物可选择性添加其它药学可接受的辅料，包括填充剂、赋形剂、润滑剂、凝胶剂、粘合剂、助流剂、崩解剂和抛射剂，可制备为散剂、胶囊、丸剂、片剂、喷雾剂、软膏剂、凝胶剂等剂型，具有恢复阴道有益菌菌群、降低阴道内pH值、抑制致病菌生长等作用。本发明所述女性专用益生菌产品的制备工艺简便易行，所用成分均为较常见且价格适中的种类，具有良好的工业化前景。本发明还提供了女性专用益生菌产品的制备工艺。