本发明公开了一种功能糖酵素及其制备方法，涉及酵素及其制备工艺技术领域，该功能糖酵素按重量份计包括以下组分：异麦芽酮糖70‑90份、苦荞麦7‑10份、藜麦3‑5份、燕麦5‑8份、青稞2‑4份、沙棘7‑10份、罗汉果5‑8份、桑叶6‑8份、葛根6‑10份、茯苓3‑6份、枳椇子3‑5份、玉竹3‑5份、苦瓜6‑8份、香菇8‑10份、猕猴桃6‑10份、芹菜7‑10份、黄瓜5‑8份。该功能糖酵素用于降低糖尿病人血糖，具有缓释能量、调节血糖等功效。