本实用新型涉及一种处理含杂环类有机物的医药废水的厌氧系统。主要解决现有UASB系统对杂环有机物去除率偏低的技术问题。本实用新型的技术方案为：一种处理含杂环类有机物的医药废水的厌氧系统，包括两个串联的UASB‑A反应器和UASB‑B反应器，在旁边设有配水池，配水池分A池、B池两部分，底部联通，UASB‑B反应器上部通过管路连接配水池B池，配水池通过管路连接提升泵B，提升泵A和提升泵B输出管路分别连接UASB‑A反应器和UASB‑B反应器底部进水口，配水池A池设有易降解有机物输入管路。本实用新型主要用于处理含杂环类有机物的医药废水。