本发明涉及食品保健或医药领域，尤其涉及一种提高益生菌在货架期内的存活率的组合物、包含该组合物的益生菌组合物以及该组合物的用途。本发明提供的组合物由以下组分组成：脱脂乳粉、无水葡萄糖、菊粉、蔗糖、麦芽糊精以及二氧化硅；此外，本发明还提供了一种益生菌组合物，由前述的组合物以及益生菌组成。本发明提供的提高益生菌在货架期内的存活率的组合物及其益生菌组合物，通过对填充剂的合理选择和使用，按照一定比例组成，通过各组分之间的协同作用，确保产品货架期内的活菌数稳定和菌株的存活，使尽可能多的益生菌通过定植于宿主的肠道内，调节肠道菌群，适用于排便不通畅者，希望提高免疫力者以及希望改善肠内环境者。