本发明公开了一种生产鲨烯的基因工程菌及其方法。该基因工程菌为大肠杆菌(Escherichia coli)中表达鲨烯合酶基因、5‑磷酸脱氧木酮糖合酶基因、异戊烯基二磷酸异构酶基因以及法尼基焦磷酸合酶基因的基因工程菌；所述鲨烯合酶基因来源于解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)。该基因工程菌异源表达解脂耶氏酵母中的鲨烯合酶，与此同时，过表达大肠杆菌内源基因dxs、idi和ispA的组合；为鲨烯合酶基因的产业化生产提供了新思路。