本发明公开了一种藜麦皂苷组合物及其在抗耐药菌方面的应用，属于医药及化妆品技术领域，本发明的藜麦皂苷组合物，由一种或多种皂苷化合物组成，通过对藜麦麸皮提取而得，通过实验证明，藜麦皂苷组合物对金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌感染的大鼠均具有明显的抑菌作用，可以促进大鼠体表伤口的愈合，提高存活率，可应用于抗耐药菌药物及化妆品，实现了藜麦麸皮的高值化利用。