本发明提供了一种医药中间体自动磨碎装置，属于制药设备技术领域，包括移动支撑架体、剪碎装置、进料斗、研磨腔、研磨辊、收集箱和控制箱，移动支撑架体上端设置工作台，工作台上端左侧设置剪碎装置，剪碎装置左侧设置进料斗，剪碎装置上端设置第一往复气缸，第一往复气缸上设置伸缩杆，伸缩杆下端设置剪碎机构，剪碎装置底端设置剪切缓冲板，剪切缓冲板右端设置引导板，引导板右端底部设置研磨腔，研磨腔内部设置研磨辊。本发明结构设计合理，操作简单，通过定时器、剪碎装置、研磨辊和第一、第二往复气缸的设置，实现了对医药中间体全自动化研磨操作，有效的降低了制药人员的工作强度的同时，提高了对医药中间体的研磨效果。