本发明提供了可利霉素生物合成连锁基因簇，共有44个基因开放阅读框，核苷酸序列全长89315 bp，其中含有5个编码聚酮合酶，包括8个模块，37个结构域，以及与聚酮合成延长单位及修饰相关的orf有9个，与糖基合成相关的orf有16个，与糖基转移相关的orf有6个。通过基因簇序列信息和结构分析，可以进一步对其产生菌进行遗传操作，获得新型、更有效的抗生素，如通过基因操作来改变其PKS合成模块式结构、进行内酯环后修饰的改变、糖基因的置换或修饰，创造新的大环内酯类抗生素，也可以通过对抗性基因或调节基因的遗传操作，提高抗生素的产量本发明所提供的氨基酸序列，可以用来分离需要的蛋白质并可用于抗体制备。