本发明属于医药技术领域，具体公开了一种用于治疗非糜烂期口腔扁平苔藓和口腔白斑的药物组合物及其应用，该药物组合物包括维A酸与抗真菌药，抗真菌药选自制霉菌素、硝酸益康唑、酮康唑或氟康唑中的任意一种。该药物组合物中的维A酸与抗真菌药联合应用起到协同增效作用，在临床上能有效治疗口腔扁平苔藓、口腔白斑的相关病因和病理，保证在口腔黏膜上作用时间，维持局部药物浓度，显著提升用药效果，减少药物入血，减少全身用药的毒副作用，减少经济负担成本。