本发明公开了一种高效环保医药废水处理方法，该方法采用微电解法和芬顿反应相结合，具体包括以下步骤：调节废水pH值；微电解反应；混凝沉淀；芬顿反应。且芬顿反应采用纳米Fe3O4/Mn3O4复合材料作为催化剂。该方法可以有效去除医药废水中的有机污染物，无二次污染，环保高效。