本发明提供了序列如SEQ ID NO : 4所示的锰型高稳定性超氧化物歧化酶在治疗自闭症中的应用。本发明采用的锰型高稳定性超氧化物歧化酶可以改善肠道菌群的生态失衡，调节肠屏蔽相关蛋白的表达，从而改善肠道和大脑的氧化压力，起到缓解和改善自闭症行为的目的，对自闭症的治疗提供了新的途径。