本发明系提供一种医疗影像处理系统，用以从一医疗影像中圈选出一最佳观察区域，包括 : 一观察区域圈选单元，系根据复数个门槛值，在一医疗影像上圈选出复数个观察区域；一异质性计算单元，系计算该等观察区域的异质性；以及一最佳观察区域圈选单元，系根据由该等异质性的相关资料所设定的一最佳门槛范围，在该医疗影像上圈选出具有最大异质性的一最佳观察区域