本实用新型公开了一种医药废水处理装置，包括依次连接的预处理沉淀池、微电解池、厌氧池、好氧池和沉淀池，其中，所述好氧池包括：L型缓冲入口，所述L型缓冲入口包括垂直设置的第一区和第二区；反应区，所述反应区设置在所述第二区的上方且与所述第一区并排设置，所述第二区的上部与所述反应区底部连通设置；第二曝气装置，设置在所述第二区底部，用于给所述反应区进行曝气处理；污泥承载装置，设置在所述反应区内，用于固定颗粒污泥。实现废水与颗粒污泥的完全接触反应，与传统的上部入口相比，能够使得废水与颗粒污泥充分的反应，且由于颗粒污泥固定设置在固定装置内，因此不易在巨大的泵送力下虽废水一起流入下一道沉淀区内。