本发明公开了一类偕二氟烷基硼酸酯类化合物及其制备方法和应用。所述化合物的结构如式(Ⅰ)所示；其中，R为或；R1为苯基、取代苯基、联苯基或噻吩；R2为氢、卤素、羟基、C1～4烷基、C1～4烷氧基、苯基、取代苯基；R3为苯基或取代苯基。本发明所述化合物结构稳定，同时具有二氟烷基和硼酸酯基，可以作为原料，更简单、方便、快捷的制备在医药学上具有高价值的化合物。此外，所述化合物的制备方法简单，制备方法的反应底物适用性广，可制备多种偕二氟烷基硼酸酯类化合物；同时，所述方法的反应条件温和，无需金属试剂，无需高温或高压，无需酸或碱添加剂，且反应时间短，操作简便，后处理简单，是一种高效合成偕二氟烷基硼酸酯类化合物的方法。