本发明公开了一种去除淫羊藿提取物中重金属离子的方法，包括以下步骤：将淫羊藿提取物溶液上样于螯合树脂柱，洗脱除去淫羊藿提取物中重金属离子。该去除淫羊藿提取物中重金属离子的方法具有工艺简单、操作方便、效率高等特点，可以有效去除淫羊藿提取物中的重金属离子，并不造成淫羊藿苷的明显降低。