本发明涉及一种调节肠道菌群平衡的组合物，该组合物采用包括如下成分的原料制备而成：洋车前子壳粉，陈皮，玉竹，普洱茶以及益生菌。本发明同时提供了所述组合物的制备方法，在制备时先用水对陈皮、玉竹以及普洱茶进行提取，所得提取液浓缩、干燥后，再与洋车前子壳粉以及益生菌混合。本发明提供的组合物可以直接服用，也可以进一步加工成防治消化不良、便秘等肠道相关疾病的食品、保健品或药物。本发明提供的组合物采用药食同源的中草药辅以相互作用的益生菌，可以调节肠道菌群平衡、改善润肠通便、缓解腹泻菌，能满足多种需求，具有广泛的应用价值。