本发明提供一种中医方剂君臣佐使训练识别方法及系统，能够解决方剂中君臣佐使训练判断的问题。所述方法包括：获取方剂，方剂的功效，以及方剂中各药物的实际剂量和其在方剂中书写的绝对位置；对方剂的功效进行拆分；将方剂中各药物的实际剂量标准化为相对剂量；将药物在方剂中的绝对位置转换为相对位置；在方剂数据库上构建基于方剂功效，药物相对剂量和药物相对位置的朴素贝叶斯分类器，确定每个药物分别在君臣佐使上的概率值，得到该药物的君臣佐使的偏性。本发明适用于中医方剂学技术领域。