本发明公开了一种荧光染料与电泳PCR双用缓冲液，包括以下各组分：甲酚红钠(1.5～2.5)*10^‑5g/L、PCR Buffer 71～75％、dNTP 5.5～6.5％、甘油4～5％、SYBR GreenⅠ0.008～0.015％和灭菌去离子水15～20％。本发明的双用染剂的具有不同检测平台的通用性，可适用不同厂牌Taq酶，至少确认可用于Invitrogen、Promega、Bioer Taq与pfu Taq，可同时用于Syber green I real‑time PCR扩增或一般PCR扩增，并且荧光PCR扩增反应后可直接进行琼脂糖电泳执行产物回收或判读，不需额外加入染色剂即可电泳，荧光PCR检测后仍可进行电泳检测，不需额外加入染色剂。缓冲液配方可以简化电泳操作时需要与染料稀释与加入核酸染剂的两个过程，特别是省略传统核酸染料EtBr等致癌物，大大增加试验的安全性。