本发明提供了属于生物医药技术领域，具体涉及鞘氨醇激酶1及其融合蛋白及其用途，一种鞘氨醇激酶1或具有其活性的氨基酸序列在制备用于预防和/或治疗肥胖、高血脂症或糖尿病的蛋白质类药物中的用途。本发明还提供了一种蛋白质类药物，所述蛋白质类药物包含鞘氨醇激酶1或具有其活性的氨基酸序列。本发明还提供了上述蛋白质类药物、编码基因、表达构建体、所述的宿主细胞在制备用于预防和/或治疗肥胖、高血脂症或糖尿病的药物中的应用。本发明人发现鞘氨醇激酶1及其融合蛋白具有显著的降血糖作用和减轻体重作用，可用于制备肥胖等代谢性疾病的控制和糖尿病的蛋白质类药物。