本发明涉及一种活性猪脑多肽的制备方法，包括将猪脑去除脑膜后，加入磷酸缓冲盐溶液高速匀浆；再按猪脑质量比加入胰蛋白酶水解1‑3小时；再用盐酸调pH至6.0，加入Protamex复合蛋白酶1.6‑2.4％，温度为50℃‑70℃水浴4小时，90‑100℃灭活10min；最后离心后取上清即得到活性猪脑多肽。还可以进一步将其超滤。按照本发明所述的制备方法得到活性猪脑多肽，提高了其水解度，增加产量和活性。