一种医药中间体的纯化装置，包括有蒸馏机构、萃取机构、吸附机构和与吸附机构连通的柱层析机构，所述蒸馏机构包括有蒸馏罐和加压机构，所述搅拌机构设置在蒸馏罐内，所述蒸馏罐通过第一连通组件与萃取机构连通，所述萃取机构包括有萃取罐和供有机溶剂进入的管道，所述吸附机构包括有容纳活性炭的吸附箱和与吸附箱连通的第三连通组件，所述萃取罐的底部通过第二连通组件与吸附箱连通，所述第三连通组件与柱层析机构连通，所述柱层析机构的底部连通有干燥组件。本实用新型通过对待纯化的溶液进行多种纯化方式的多次纯化，提高医药中间体纯化的质量，从而提高医药生产的质量。