一种西瓜籽油的制备方法，属食品医药领域的天然产物提取技术。本发明方法的工艺过程是：西瓜籽经过清选、分级后，进行低温干燥，然后冷却、脱硬皮，再去除变质变色和未脱硬皮的西瓜籽，然后对小颗粒西瓜籽仁进行调质，加入3％～12％的热水，水温60℃～80℃，然后对西瓜籽仁进行两次冷压榨，分别用板式过滤机和袋式过滤机对两次冷压榨的毛油进行两次过滤，最后将二次压榨饼进行细粉，过筛粒度控制在50‑90目，用超临界二氧化碳萃取两次过滤后的毛油及二次压榨饼残油中不饱和脂肪酸纯化，即得成品西瓜籽油。本发明方法制得的西瓜籽油天然无污染，且其中的营养成分不发生变化，含有大量的不饱和脂肪酸，产品纯度高、品质优。