本发明实施例公开了一种根据基因突变信息对样本分类的方法、装置、设备及介质，所述方法包括：获取与至少两个待分类的样本分别对应的突变基因集合，并根据基因间关系图对各所述突变基因集合进行关联基因的扩充；将扩充后的各所述突变基因集合进行合并，并将合并结果划分为与至少两个样本类别分别对应的突变基因分类集合；采用所述突变基因分类集合，对各所述样本进行分类。本发明实施例的技术方案能够优化现有的基于突变基因的样本分类方式，从而提高分类准确性。