本发明公开了一种蓝莓吡喃花青素苷元微胶囊及制备方法。蓝莓吡喃花青素苷元微胶囊采用锐孔凝固浴法制备，壁材采用了海藻酸钠以及壳聚糖，乳化剂采用了吐温80，将蓝莓吡喃花青素甘元粉末进行了包裹，凝固浴采用了氯化钙溶液，待微胶囊固定一定时间后, 进行洗涤、分离和冷冻，最后将其真空冷冻干燥得到所述蓝莓吡南花青素苷元微胶囊。该产品的特点是：可连续化生产、生产周期短、所用试剂安全无毒、设备要求低，该产品对研发高附加值蓝莓相关产品、以及提高吡喃花青素的稳定使用具有重要意义。本发明制得的微胶囊产品营养安全、稳定、易于存储，在食品、医药领域有着广泛的应用前景。