本发明公开了犬成纤维细胞生长因子21及其在治疗犬内分泌疾病中的用途。本发明犬成纤维细胞生长因子21(cFGF21)的氨基酸序列为SEQ ID NO : 2所示，其编码基因序列为SEQ ID NO : 1所示。本发明以犬肝脏细胞核酸为模板，PCR扩增出cFGF21基因，在大肠杆菌Rossetta(DE3)中获得高效可溶性表达的cFGF21。动物学试验结果表明，本发明cFGF21能够有效降低动物体内的血糖水平，此外，本发明cFGF21在降低血糖水平方面还具有药效持续时间长的优点。本发明cFGF21可作为药物治疗犬糖尿病，肥胖，代谢综合症或脂代谢紊乱等内分泌疾病。