本发明属于蛋白质医药生物工程与技术领域，公开了一种蛋白卵磷脂化修饰的方法。该方法将含无机盐的缓冲体系、被修饰蛋白、磷脂酰胆碱活性酯的有机溶液在4℃‑30℃下混匀，静置修饰0.1h～96h。本发明所述蛋白卵磷脂化修饰的方法可以提高蛋白卵磷脂化修饰的效率，同时提高修饰后的卵磷脂化蛋白的收率和纯度。