本发明属于医药技术领域，涉及一种细胞自噬抑制剂与阿法替尼药物组合物及其在制备肿瘤增效制剂中的用途，本发明的组合药物, 其通过阿法替尼显著抑制肿瘤细胞的增殖并诱导肿瘤细胞凋亡, 以及诱导肿瘤细胞发生细胞自噬, 在阿法替尼杀伤肿瘤细胞中细胞自噬起到保护肿瘤细胞的作用, 使抑制细胞自噬达到明显増强阿法替尼对肿瘤细胞的杀伤的效果。本发明能降低阿法替尼治疗用量及用药产生的毒副作用并减少耐药的产生，同时降低治疗成本。本发明通过联合或序贯的使用方式用于干预治疗慢性髓系白血病、肝癌、乳腺癌和非小细胞肺癌，尤其是EGFR突变和HER2突变引发的肿瘤。