本发明公开了CTSD基因可以作为呼吸道合胞病毒感染早期诊断的分子标志物。本发明利用二代测序和QPCR的方法发现CTSD基因在正常人和呼吸道合胞病毒感染患者的血液中的表达存在显著差异，即可以通过检测血液中CTSD基因表达情况来判断待试者是否感染了呼吸道合胞病毒。根据两者的相关性，本发明开发了一种诊断呼吸道合胞病毒感染的试剂盒，该试剂盒通过检测CTSD基因的表达从而进行呼吸道合胞病毒感染的诊断。本发明的诊断试剂盒可用于疾病的早期诊断，在临床上具有广泛的应用前景。