本发明涉及一种提取木质纤维素中木质素的方法，包括如下步骤：将粉碎干燥后的木质纤维素原料与珍珠粉一同球磨，向球磨后的混合物中加入萃取剂进行萃取，萃取前以及萃取过程中通过加入超临界CO2来控制萃取压力为10Mpa~30Mpa，对萃取液进行蒸发得到木质素晶体。本发明还公开对该提取木质纤维素中木质素的方法的应用。本发明是一种环保、经济、反应条件适合生物质材料的清洁、高效的提纯木质素的方法。