本发明公开了一种RGD类肽修饰的灯盏花乙素冻干制剂及其制备方法，所述冻干制剂包含质量百分浓度0.1％‑10％的RGD类肽修饰的灯盏花乙素，质量百分浓度1％‑10％的药用辅料。将RGD类肽修饰的灯盏花乙素、药用辅料溶解混合，混合溶液经0.22μm过滤器除菌过滤，100℃流通蒸气灭菌15min，然后灌装，按冻干曲线的设置冷冻干燥，便获得RGD类肽修饰的灯盏花乙素冻干制剂。该制备方法操作简单，工艺成熟可控，而且在22h之内完成冻干，在确保产品质量的同时，生产能耗下降，降低了生产成本。本发明所述RGD类肽修饰的灯盏花乙素冻干制剂稳定性好、安全性高、抗血小板集聚的药理作用更优，临床上可用于防止心肌供氧动脉闭塞、心脏病发作、不稳定性心绞痛、无Q波心肌梗塞、冠脉介入治疗引起的猝死。