本发明涉及人自噬基因atg10的基因和蛋白影响RNA病毒复制的新功能及其应用，具体是利用人自噬基因atg10的两种全长编码区(CDS)序列及其调控区序列(涉及但不限于启动子序列、第一、第二、第三和第四内含子序列)，以及由atg10基因两种编码序列翻译的两种ATG10蛋白分子ATG10‑L和ATG10‑S，包括其序列类似物和microRNAs等为靶点或目标物，通过基因操作、筛选、原核和真核细胞的体外表达等研发新的抗RNA病毒的蛋白类新药及相关产品；通过筛选可调控两种ATG10蛋白差异性表达的化合物研发具有新的作用靶点的抗RNA病毒的新药候选化合物。