本实用新型公开了一种蛋白制品巴氏灭活装置系统，包括反应罐、过滤器和巴氏灭活罐，其特征在于，所述系统进一步包括：一混合搅拌桨，设置于所述巴氏灭活罐中，所述混合搅拌桨包括一桨轴和沿所述桨轴纵向布置的至少两桨叶组，所述桨叶组中的任何一组包括至少两片桨叶。本实用新型所提供的巴氏灭活装置系统，在传统的巴氏灭活装置系统的基础上能够达到最佳的传热、传质效果，并且温控效果更佳，由此保证巴氏病毒灭活达到最佳效果。