本发明涉及医药设备的技术领域，公开了药物配发系统和配发方法，其中药物配发系统，包括能够相互通信的药篮、服务器、数据处理终端和便携终端；药篮设有电子标签和指示装置；服务器发送处方信息至便携终端；便携终端用于显示处方信息以及对电子标签进行读写；数据处理终端包括转换模块和查询模块，转换模块将处方并转换为处方信息；查询模块在核对匹配后外发查询数据信号至各电子标签；在电子标签与查询数据信号相匹配时指示装置发出指示信号。本发明中的药物配发系统和配发方法，在配药中实现电子化操作，减少了人工参与，减少了操作员的工作量，继而提高了工作效率和配药准确性，减少了取药排队的速度。