本发明公开了一种治疗幽门螺杆菌感染的药物组合物及其用途。该药物组合物包括质子泵抑制剂7.5～40重量份；抗生素150～1000重量份；铋剂220～300重量份和挥发性提取物60～140重量份；其中，所述的质子泵抑制剂选自奥美拉唑、兰索拉唑、埃索美拉唑、泮托拉唑或雷贝拉唑中的一种；所述的抗生素选自阿莫西林、克拉霉素、左氧氟沙星、甲硝唑、呋喃唑酮、四环素或米诺环素中的一种；所述的铋剂选自枸橼酸铋钾、胶体次枸橼酸铋或胶体果胶铋中的一种；所述的挥发性提取物为从土荆芥和水团花中提取出的挥发性组分。本发明的药物组合物能够提高幽门螺杆菌的根除率和有效率，降低耐药率和不良反应发生率。