本发明提出了一种快速分离纯化nujiangexanthone A的方法，具体包括如下步骤：将怒江藤黄枝或叶粉末用提取溶剂室温渗漉提取或冷凝回流提取，减压浓缩至提取液无有机溶剂味，得浸膏A；对浸膏A进行硅胶柱柱层析分离：用洗脱剂进行洗脱，经薄层层析检测，收集馏分，减压浓缩，得浸膏B；对浸膏B进行硅胶柱柱层析分离：用洗脱剂进行洗脱，经薄层层析检测，收集馏分，减压浓缩，得浸膏C；对浸膏C采用高速逆流色谱分离，经薄层层析检测，收集合并馏分，减压浓缩，得粗品D；对粗品D进行Sephadex LH20凝胶柱纯化，用洗脱剂进行洗脱，经薄层层析检测，收集合并馏分，减压浓缩，得到目标化合物nujiangexanthone A。本发明的方法效率高，操作简单，可操作性强，制备量大，易于放大生产。