本发明公开了一种黄芩的鉴定方法，所述鉴定方法以黄芩制备得供试品溶液，以溶解有黄芩苷对照品、汉黄芩苷对照品、黄芩素对照品、汉黄芩素对照品的溶液为对照品溶液，通过高效液相色谱仪测定分别得供试品溶液和对照品溶液的液相色谱；将得到的液相色谱导入中药色谱指纹图谱相似度评价系统分析，分析得到黄芩指纹图谱，采用层序聚类分析、主成分分析、或偏最小二乘分析处理该黄芩指纹图谱数据，从而对黄芩或其炮制品进行分类鉴别。本发明在建立黄芩指纹图谱的基础上，测定了黄芩指标成分含量，结合不同的化学模式识别方法，可以对黄芩的产地、炮制和外观性状有效判别和区分。