本实用新型提供了一种医药废水处理装置，包括：过滤器、絮凝箱、二次过滤器、蒸馏室、储藏箱、储液箱及水质检测仪，所述过滤器与絮凝箱通过管道连接，所述过滤器与絮凝箱之间设有水泵A，所述絮凝箱的上端设有电机，所述电机上连接有搅拌器，所述搅拌器伸入到絮凝箱底部，所述絮凝箱与二次过滤器通过管道连接，所述絮凝箱与二次过滤器之间设有水泵B，所述二次过滤器的内部设有倾斜的二次过滤层，所述二次过滤层的倾角最低端的箱体上设有出污口，所述二次过滤器的下端通过管道与蒸馏室连接，所述蒸馏室通过管道与储藏箱、储液箱分别连接。本实用新型提供的一种医药废水处理装置，净化效率高，效果好，能够回收有机物。