本实用新型提供了一种胶囊气动输送机构，属于医药设备技术领域。本胶囊气动输送机构包括下料斗、控制管和输料管，控制管的上端连接下料斗，控制管的下端连接一气泵，控制管的中部与输料管相连通，套管内插设有一插杆，插杆的上端固定设置有一活塞，插杆与套管内壁之间连接有一复位弹簧，套管与控制管的管壁之间固定相连；控制管与气泵之间设置有能够使气流间歇性进入控制管的气流控制结构；活塞的上方设置有一螺杆，螺杆的下端与活塞之间通过平面轴承相连，螺杆的上端插设在下料斗内，下料斗内固定设置有一螺纹套，螺杆插设在螺纹套内，螺杆与螺纹套之间螺纹连接，螺杆上还设置有螺旋状的输送瓦片。本实用新型具有能够防止物料堵塞等优点。