本发明公开了一种无毒工艺制备水性聚氨酯的方法以及由该方法制备的水性聚氨酯，所述方法包括：将二环己基甲烷二异氰酸酯与脂肪族二元醇按照摩尔比2.5‑4混合，在70‑90℃下反应3‑5小时得到预聚体，加入含亲水基团的二羟甲基丁酸，反应3‑5小时，加入KOH的水溶液乳化分散，滴加二胺扩链剂扩链和聚乙酰胺，得到一种水性聚氨酯乳液。本发明采用脂肪族异氰酸酯二环己基甲烷二异氰酸脂、脂肪族聚合二元醇，不含制备水性聚氨酯常用的NMP、丙酮等有机溶剂，也不含三乙胺等常用中和剂，可以制得完全无毒的聚氨酯材料，其可广泛用于医药卫生、食品、家居用品领域。