一种当归黄芪间作种植方式，该方法包括于待耕种土地上挖孔穴；将当归和黄芪种植于孔穴内；黄芪按照预定的间作方式同期种植于当归行间；所述当归和黄芪的种植方式为育苗移栽。该方法能够增加土壤微生物多样性，降低土传病害发病率，减少农药的使用，有效缓解当归和黄芪的连作障碍，提高耕地使用效率，提高当归和黄芪的产量，改善当归和黄芪的品质，为规范化种植中药材提供一定参考。