本发明公开的是一种分段复合酶解提取乌贼墨小分子硫酸粘多糖的工艺，所述工艺包括以下具体步骤：原料处理—>一次酶解—>二次酶解—>分离纯化干燥，制得乌贼墨小分子硫酸粘多糖。本发明不仅可以有效地提高乌贼墨小分子硫酸粘多糖的提取率，而且所制得的硫酸粘多糖含量纯度更高，分子量更稳定，同时，本工艺不需要使用有机溶剂及化学品，是一种纯天然的提取制备工艺，更加环保无污染。