本发明涉及中医药技术领域，具体地涉及一种治疗内皮细胞功能障碍性冠状动脉微血管疾病的中药组合物。所述组合物由以下质量配比的中药原料制备而成：党参12‑18、水蛭8‑12、全蝎8‑12、蜈蚣9‑11、红花12‑18、赤芍10‑14、乳香5‑7、没药5‑7、冰片5‑7、龙骨10‑14、牡蛎10‑14。本发明的中药组合物重在祛瘀通脉，行气止痛，气脉常通，人即安和，可有效治疗内皮细胞功能障碍性冠状动脉微血管疾病。