一种富含乳清蛋白多肽的产品及其制备方法、应用，属于食品加工技术领域。该产品通过以下步骤制得：1)复水乳清蛋白溶液的制备；2)部分水解乳清蛋白的制备；3)肽段筛分；4)调配；5)步骤4)中获得的调配后的原料，通过本领域技术人员已知的任何途径制成经口摄入的产品。该产品的摄入，能够在不使用益生菌制剂的情况下，促进抗生素治疗后肠道菌群失调的恢复。