本发明公开了一种胃肠吸收障碍专用型临床营养组合物，包括以下重量的组分组成：20‑30g蛋白质、3‑10g益生菌、55‑66g碳水化合物、10‑20g膳食纤维、0.6‑1.2g常量元素、0.01‑0.03g微量元素、0.005‑0.02g脂溶性维生素、0.1‑0.3g水溶性维生素、0.05‑0.2g膳食精华、0.5‑6g中药成分、0.1‑1g天然植物化合物以及0.1‑0.6g新资源食品；本发明还提供上述临床营养组合物的制备方法。本发明的临床营养组合物通过营养支持来促进胃肠道的蠕动，调节胃肠道的内分泌、肠内菌群，修复胃肠道的粘膜屏障，增强胃肠道的免疫力并且联合中医药的思想来调节胃肠道的气机升降。从而达到恢复胃肠道的细菌内环境的平衡、平稳内分泌以及调节胃肠道的气机升降。