本发明属于生物医学技术领域，公开了一种胃粘膜组织蛋白样品的制备方法，出生12h内的胎鼠，取出胃组织，用无菌PBS清洗胃组织表面2次，去除结缔组织，之后再用无菌PBS清洗一次；将冲洗干净的胃组织剪成2‑3mm2的碎块，之后转入15ml离心管中，加入0.1％胶原酶Ⅱ+0.2mg/ml透明质酸酶的混合酶，水浴振荡消化；最后用完全培养基重悬细胞，转入培养瓶中，置于37℃，5％CO2培养箱条件下培养。本发明能够有效的去除胃粘液，把胃粘膜制备成单细胞悬液，可以进行胃粘膜流式细胞术等单细胞的蛋白分析研究，为在胃组织开展细胞组学做好准备。本发明解决了过程繁琐，耗时长；费用高的问题。