本发明公开了一种用于中药和西药融合的数据分析方法，包括以下步骤，S1：建立数据库，数据库中的数据包括方剂、中药、基源植物、天然产物、药物靶点和活性配体分子；S2：根据各方剂找到对应的中药，根据对应中药的化学成分找到对应药物靶点，建立方剂－中药化学成分－药物靶点的网络；S3：筛选出与中药的化学成分相似度较高的天然产物，通过筛选出的天然产物找到具有相似成分的基源植物；S4：从药物靶点出发，找出该药物靶点对应的活性配体分子，通过对比活性配体分子与天然产物的相似度，筛选相似度较高的天然产物，最后通过天然产物确定对应的基源植物。本发明数据分析方法结合中药与现代药理研究结果，实现中药作用机制的量化阐释。